Studijní agendu doktorského studia zajišťují na jednotlivých fakultách oddělení doktorských studií v rámci studijního oddělení, nebo oddělení (podpory) vědy. Jedná se o nejvýznamnější informační pracoviště pro doktorandy. Mezi základní činnosti patří mimo jiné organizace zápisů do studia, poskytování informací týkajících se přijímacího řízení na fakultu, účelových stipendií, státních závěrečných zkoušek, disertačních prací či promocí. Na některých fakultách sdružují tato oddělení také agendu pedagogické a publikační činnosti, zahraničních stáží a grantových soutěží. Příslušná fakultní oddělení organizují také celou řadu akcí a seminářů. Odkazy na kontakty obsahuje následující seznam.

Kontakty na fakulty: