Vzdělávání prostřednictvím elektronické formy je zajišťováno systémem Moodle (Modular Object-Oriented Dynamic Learning Environment), jehož provoz administruje Ústřední knihovna UK. Některé fakulty Univerzity Karlovy provozují i své vlastní instalace tohoto systému, jež umožňují nejen vyučujícím založit výukový kurz a vkládat studijní materiály vyučujícím, ale mimo jiné studentům vkládat kometáře.

Online kurzy nabízí také Ústav jazykové a odborné přípravy.